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Abstracto

Detección temprana del cáncer colorrectal mediante tecnología xna

Michael J. Powell

Los científicos de DiaCarta han desarrollado una innovadora tecnología de fijación molecular de ácidos xenonucleicos, o tecnología XNA, para abordar las necesidades de sensibilidad para la mutación de genes tumorales y otras mutaciones genéticas importantes en biopsias líquidas y muestras FFPE. La tecnología XNA utiliza oligómeros XNA de diseño patentado con cadenas principales modificadas que hibridan secuencias de ADN objetivo de interés mediante el emparejamiento de bases Watson-Crick. Cuando la secuencia es una coincidencia completa, los XNA se hibridan estrechamente con las secuencias objetivo de ADN, bloqueando la elongación de la cadena por la ADN polimerasa en la reacción de PCR. Sin embargo, cuando hay una mutación presente en la secuencia objetivo, el desajuste conduce a la inestabilidad del dúplex oligómero XNA:ADN, lo que permite la elongación de la cadena por la ADN polimerasa. Como resultado, solo se selecciona la secuencia objetivo que contiene mutaciones para la amplificación y la secuencia de tipo salvaje, a pesar de estar presente en cantidades/copias de ADN mucho mayores, no se amplificará. Dado que las ADN polimerasas no reconocen los oligómeros XNA, no pueden servir como cebadores en las reacciones de PCR en tiempo real posteriores. Los ensayos de pinzas moleculares XNA son altamente sensibles y utilizan ácidos nucleicos obtenidos a partir de muestras de biopsia líquida o biopsia de tejido tumoral (FFPE). El límite de detección (LOD) puede alcanzar un mínimo de 0,5 % (7 u 8 copias de ADN mutante) en 5 ng de ctDNA, aproximadamente equivalente a 2 ml de sangre de un paciente. Dado que se ha descubierto que la presencia de altos niveles de ADN tumoral mutante libre de células circulantes (ctDNA) y ácidos nucleicos derivados de exosomas está asociada con una baja supervivencia en el cáncer colorrectal y otros cánceres, el monitoreo dinámico del nivel se puede utilizar como un factor predictivo para el tratamiento del cáncer.