Muhammad Asif Rasheed
La apoE4 es un factor de riesgo genético importante debido a su mayor incidencia en el desarrollo de la enfermedad de Alzheimer. El estudio fue diseñado para predecir compuestos que podrían ser útiles en el diseño de fármacos para suprimir la hiperactividad de la proteína apoE4. Se utilizaron 22 compuestos naturales (marinos, derivados de microorganismos y plantas) como inhibidores y se acoplaron a la apoE4 (PDB id 1B68). Se acoplaron 6 compuestos sintéticos (en ensayos clínicos) a la proteína objetivo para comparar y analizar los resultados del acoplamiento con compuestos naturales. Los compuestos S-alil-L-cisteína, galato de epicatequina y ácido fúlvico muestran una alta afinidad de unión, es decir, -7,1, -7 y -7 respectivamente. El galato de epicatequina muestra enlaces de hidrógeno con Gln156 y Asp35 y el ácido fúlvico muestra enlaces de hidrógeno con Glu27. En el caso de los compuestos sintéticos, Tideglusib no mostró enlaces de hidrógeno con ningún residuo de aminoácido de ApoE4, pero mostró una alta afinidad de unión de -7,2, al igual que el compuesto natural S-Allyl-L-Cysteine, que mostró una alta afinidad de unión de -7,1, pero no mostró enlaces de hidrógeno con ningún residuo de aminoácido. Las interacciones proteína-proteína de apoE4 muestran interacción física y funcional con proteínas relacionadas. Nuestro estudio predice un compuesto Epicatechin Gallate sobre la base de la afinidad de unión y los enlaces de hidrógeno con el residuo de aminoácido como un posible compuesto principal que puede usarse como inhibidor.