La contaminación de los sistemas acuáticos (ejemplos: lagos, ríos, océanos, acuíferos y aguas subterráneas) por grandes cantidades de material de desecho que modifican el agua de forma negativa se denomina contaminación acuática. Este tipo de privación ecológica ocurre cuando los contaminantes nocivos se descargan directa o indirectamente en los sistemas acuáticos sin eliminar los compuestos nocivos. La contaminación acuática conduce directamente al sufrimiento de los organismos y la vegetación que sobreviven en el agua, incluidos los anfibios. La principal fuente de contaminación acuática incluye desechos industriales, actividades mineras, aguas residuales y aguas residuales, vertidos marinos, quema de combustibles fósiles, fugas accidentales de petróleo, calentamiento global, deposición atmosférica, desarrollo urbano, etc.